Еукаріотіческіх хромосом поділяються на незалежні доменів з різних хроматин структур (euchromatin і heterochromatin). Більшість гени, що знаходяться всередині euchromatic доменів, які пов'язані з нерегулярними nucleosomal масивів збагачений гістони (основні білків клітин ядер), які є hyperacetylated і метильований в лізину 4 гістони H3. Таких nucleosomal змін встановити хроматин структури, які є в цілому досить на фактор транскрипції генів і асоціації транскрипції.

В межах зазначеного домену euchromatic, сусідніх гени часто відображення структури інакший вираз, із зазначенням різних функціональних областей, що існують у межах великої euchromatic області. Transcriptionally активних euchromatic доменів перемежовуються з гетеро хроматичної регіонів, що ген бідних і організовані в регулярних масивів hypoacetylated nucleosomes, які є метильований в лізину 9 гістони H3. Heterochromatic гістони модифікацій створення платформи для взаємодії з білками, які поширюються в СНД напрямку вздовж хромосоми і обмеження транскрипції фактор доступ до цільової послідовності. A-клас елементів дезоксирибонуклеїнової кислоти (ДНК), відомий як ізоляторів визначає переходи між структурними і функціональними хроматин доменів.