Захворювання, в якому імунна система, природно покликана захищати тіло від іноземних загарбників, такі як віруси та бактерії, натомість перетворюється проти і призводить до пошкодження здорових тканин організму. Імунна система є складною організацією в організмі, який зазвичай покликаний "шукати і знищити" загарбників тіла, в тому числі інфекційних агентів. Хворих з аутоімунних захворювань часто мають незвичайні циркулюючих в їх крові антитіла, які орієнтовані на своїх власних тканин організму.

Аутоімунних захворювань прикладами системний червоний вовчак, Шегрена синдром, тиреоїдит Хашимото, ревматоїдний артрит, діабет неповнолітніх (тип 1), polymyositis, склеродермія, Addison хвороби, вітіліго, злоякісна анемія, гломерулонефрит і Легеневий фіброз.

Аутоімунне захворювання є частіше зустрічається у жінок, ніж у чоловіків. Відчував, що естрогену жінок може вплинути на імунну систему, привертають деякі жінки аутоімунних захворювань. Далі, наявність одного аутоімунної хвороби збільшує шанс для розробки іншого синхронний Аутоімунні захворювання.